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NEJM雄文速读:宏基组技术如何在真实临床世界帮助诊断脑炎脑膜炎
2019-06-15
继第一例应用NGS技术实现钩端螺旋体脑炎的病原学诊断的文章发表后,开启了应用mNGS技术脑(膜)炎病原学诊断的新纪元。时隔6年,Michael Wilson教授团队再次在《the NEW ENGLAND JOURNAL of MEDICINE 》发文。
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NEJM和BioRxiv文章教你怎么用mNGS诊断脑炎及脑膜炎(一)
2019-06-24
2013年美国C.Y.Chiu教授首次应用mNGS技术诊断了14岁小男孩的钩端螺旋体脑病并挽救了他的生命,引起了全球神经科医生对mNGS技术在病原体检测方面应用的巨大兴趣,并着手进行了探索性研究。2016年在中国,西京医院赵钢教授率团队启动了...
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JAMA Oncology文章共享:游离DNA测序检测血液系统肿瘤患者血行感染中病原菌的效能评估
2019-12-21
2019年12月19日,圣犹达儿童研究医院传染科Kathryn P. Goggin,et al在《JAMA Oncology》(IF,22.416)上发表Evaluation of mcfDNA-seq to Predict Bloodstream Infection in Pediatric Patients With Cancer...
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微生物检测流程
MICROBIAL TESTING PROCESS
目前公司使用的是二代测序技术(Next Generation Sequencing,NGS)
检测速度快 | 准确率高 | 成本低 | 覆盖面广

近年来,随着耐药病原微生物的增多、少见病原微生物的出现以及免疫抑制或受损宿主的增加,感染的发病率和死亡率仍居高不下,严重感染患者病死率高达50%。

基于此公司现已成功研发出国内首款具有国际领先水平的云端病原微生物数据分析系统PACE(Pathogen Capture Engine)

结合Illumina的开源数据分析软件和第三方软件,可实现从图像捕获、可视化展示到生物学意义的分析。Illumina基因分析仪Pipeline软件包可对数据进行初步分析,实现从图像捕获到强度信号值的转化,并经计算转换为碱基序列。

我们可对临床样本(脑脊液、血液、肺泡灌洗液、无菌体液、组织等)进行病原微生物DNA序列测定,能够快速、准确、客观地检测出临床样本中的多种微生物,无需培养或特异性扩增。

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检测平台介绍
INTRODUCTION
TO TESTING PLATFORM
目前公司使用的是二代测序技术

Illumina测序技术结合了微阵列技术和专有的可逆终止子技术进行大规模平行的边合成边测序。此技术在一定程度上确保了高精确度和单碱基逐个测序,可有效减少同聚物和重复序列的测序错误。

结合Illumina的开源数据分析软件和第三方软件,可实现从图像捕获、可视化展示到生物学意义的分析。Illumina基因分析仪Pipeline软件包可对数据进行初步分析,实现从图像捕获到强度信号值的转化,并经计算转换为碱基序列。

此外,与其他第三方软件联合使用,可实现完整灵活的生物信息分析,如序列拼接、结构变异、定量、功能注释、功能分类、新基因及调控区域预测等,深入挖掘测序数据的生物学意义。

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北京实验室
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南京实验室
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西安实验室